Ο Ιερός Ναός βρίσκεται στην κεντρική πλατεία του Σταυρού και κάθε χρόνο πανηγυρίζει την Μεταμορφώσεως του Σωτήρος στις 5 και 6 Αυγούστου, με δύο απο τα μεγαλήτερα πανηγύρια του νησιού. 

Ο Ιερός ναός κοιμήσεως της Θεοτόκου, βρίσκεται στο δρόμο για τηνΠαλαιοχώρα και είναι πιθανό όταν ήταν η πρωτεύουσα της Ιθάκης να ήταν Μητροπολιτικός ναός.

Ο Ναός της Παναγίας στην Ανωγή Ιθάκης, κτισμένος σε υψόμετρο 500μ, είναι ένας από τους μεγαλύτερους, σημαντικότερους και αρχαιότερους ναούς των Βαλκανίων.

Το εκκλησάκι βρίσκεται στο Περαχώρι και είναι αφιερωμένο στην Μετάσταση του Άγιου Ιωάννη του Θεολόγου και γιορτάζει στις 26 Σεπτεμβρίου.  

Κοντά στο Περαχώρι, 3 χλμ. νοποδυτικά του χωριού στη θέση Βουνί λειτουργούσε το μοναστήρι των Ταξιαρχών.

Ο ναός βρίσκεται στην Περιοχή βουνάκι στο Βαθύ. Το 1840 ήταν εξωκκλήσι και επεκτάθηκε από τις οικογένειες Βλασσοπούλου. Υπήρχε νεκροταφείο μέχρι το 1953.

Η Παλαιά Μητρόπολη του Νησιού, ο Ιερός ναός της Παναγίας βρίσκεται στο Βαθύ και οχτίστηκε το 1800.

Ο Αγιος Νικόλαος βρίσκεται στην περιοχή Παλιόρογκα στο Βαθύ. Είναι παλαιά εκκλησία όπου διασώζονται τάφοι.

Η Ζωοδόχος Πηγή βρίσκεται πάνω από τα Κανελάτα και κτίστηκε γύρω στα 1900. 

Ο ιερός ναός του Αγίου Ραφαήλ κτίστηκε τη δεκαετία του 1980 και φυλάσσονται εκεί τα οστά του Αγιού Ραφαήλ.