Το εκκλησάκι της Αγίας Παρασκευής στο Περαχώρι είναι χτισμένο ψηλά στο βουνό, πάνω από το χωριό, στο ίδιο ύψος με τον "Αφεντικό Λόγγο" (ένα μάλλον μικρό, αλλά πανέμορφο δάσος βελανιδιών), στην απέναντι πλαγιά.

Στη Ν.Α. πλευρά της Ιθάκης, στο ακρωτήρι Μούντα βρίσκεται το εκκλησάκι του Αϊ-Γιάννη

Το πότε χτίστηκε για πρώτη Φορά δεν είναι γνωστό.

Το 1927 οι Περαχωρίτες Ιωάννης Κασσιανός (Τσάρας), Σπύρος Δρακόπουλος (Τσιμπούκας) και Παναγής Κόμητας αποφάσισαν να ξαναχτίσουν το ερειπωμένο εξωκλήσι.

Πάνω στο μικρό νησάκι Λαζαρέτο στη μέση του λιμανιού της Ιθάκης βρίσκεται το όμορφο εκκλησάκι της Μεταμόρφωσης του Σωτήρος. Γύρω γύρω είναι φυτεμένα πεύκα.

Το εξωκλήσι του Αγίου Παντελεήμονα βρίσκεται στην περιοχή Φιλιατρό, πιο πάνω από την παραλία με τα πεντακάθαρα νερά.

Πριν 300 περίπου χρόνια στην περιοχή Δεξά, αρκετά πάνω από το δημόσιο δρόμο, χτίστηκε ένα μικρό εξωκλήσι προς τιμή της Παναγίας μας, της'Ήαναγούλας", όπως την αποκαλούσαν οι πιστοί.

Το εκκλησάκι του Αγίου Κωνσταντίνου βρίσκεται στην περιοχή Κανελάτα, στο Βαθύ Ιθάκης, πάνω στο δρόμο που οδηγεί στο Σαρακήνικο και στο Φιλιατρό.

Στο διάσελο μεταξύ εμπρός και πίσω Αετού είναι χτισμένο το εξωκλήσι του Μεγαλομάρτυρα Αγίου Γεωργίου.

Στην περιοχή του Πίσω Αετού και συγκεκριμένα λίγο πριν τον αρχαιολογικό χώρο της πόλης των Αλαλκομενών, είναι το εξωκλήσι του Οσίου Θεοδώρου του Ηγιασμένου, ο οποίος υπήρξε μαθητής του Αγίου Παχωμίου.

Στο δυτικό μέρος της πόλης (Βαθύ), πάνω από την περιοχή του Κάβου, στην πλαγιά του βουνού είναι χτισμένο το μικρό εκκλησάκι του Αγίου Φανουρίου.

Στον μπροστά Αετό, λίγα μόνο μέτρα πάνω από τη θάλασσα, με άμεση πρόσβαση στο δημόσιο δρόμο, βρίσκεται το μικρό, όμορφο εκκλησάκι του Αγίου Νικολάου.